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分子病理学靶点定位测定

2025-07-30 关键词:分子病理学靶点定位测定测试标准,分子病理学靶点定位测定项目报价,分子病理学靶点定位测定测试周期 相关:
分子病理学靶点定位测定

分子病理学靶点定位测定摘要:分子病理学靶点定位测定是通过分子生物学技术对肿瘤及相关疾病组织、细胞或体液中的特定基因、蛋白质或核酸靶点进行精准空间定位与定量分析的核心技术,核心对象包括驱动基因突变位点、癌基因/抑癌基因表达产物、基因拷贝数变异(CNV)及融合基因等,关键项目涵盖靶点表达定位、突变类型鉴定、拷贝数变化分析等,为临床靶向治疗、预后评估及生物标志物发现提供重要分子依据。

参考周期:常规试验7-15工作日,加急试验5个工作日。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

检测项目

基因靶点定位检测:

  • 荧光原位杂交(FISH):靶点基因拷贝数(信号数/细胞,参照ASTME2363-19)、融合基因断裂位点定位(双色探针重叠率≥80%)
  • 原位聚合酶链反应(insituPCR):目标基因片段扩增产物定位(细胞内信号分布)、突变位点空间定位(突变型探针杂交信号强度)
蛋白质靶点定位检测:
  • 免疫组织化学(IHC):目标蛋白表达定位(细胞定位:胞核/胞质/胞膜)、表达强度评分(H-score:0-300,参照ASCO/CAP指南)
  • 免疫荧光(IF):蛋白共定位分析(两种靶点荧光信号重叠系数≥0.7)、磷酸化蛋白激活状态定位(磷酸化位点特异性抗体染色)
核酸靶点定量检测:
  • 实时荧光定量PCR(qPCR):靶基因mRNA表达量(Ct值≤35,相对定量:2^-ΔΔCt)、microRNA表达水平(ΔCt值差异≥2倍)
  • 数字PCR(dPCR):突变等位基因频率(MAF,≥0.1%)、循环游离DNA(cfDNA)靶点浓度(copies/μL)
突变位点鉴定:
  • Sanger测序:单核苷酸变异(SNV)位点(如EGFRexon19缺失、ALKL1196M)、插入/缺失突变(indel)长度(±1bp)
  • 下一代测序(NGS):高频突变位点覆盖度(≥1000×)、突变丰度(≥1%)
融合基因检测:
  • RNA-seq:融合基因转录本序列(覆盖融合断点≥50bp)、融合基因表达量(TPM≥1)
  • 反转录PCR(RT-PCR):融合基因产物长度(±2bp)、融合类型(顺式/反式融合)
拷贝数变异分析:
  • 阵列比较基因组杂交(array-CGH):基因拷贝数变异(CNV)片段大小(≥50kb)、拷贝数变化倍数(≥2倍或≤0.5倍)
  • 多重连接依赖探针扩增(MLPA):靶基因拷贝数(±1copy)、拷贝数变异区域定位(染色体臂水平)
甲基化状态检测:
  • 亚硫酸氢盐测序:CpG岛甲基化率(≥5%)、甲基化位点分布(启动子区域)
  • 甲基化特异性PCR(MSP):甲基化等位基因比例(≥10%)
microRNA靶点验证:
  • 双荧光素酶报告基因assay:靶基因3'UTR结合位点验证(荧光活性降低≥50%)、microRNA-mRNA相互作用强度(相对荧光值比值)
  • RNA免疫沉淀(RIP):结合靶mRNA的microRNA富集倍数(≥2倍)
循环肿瘤细胞(CTC)靶点检测:
  • CTC表面标志物定位:EpCAM(细胞膜定位)、CK19(胞质定位)
  • CTC内靶点基因检测:EGFR突变(exon19缺失)、HER2扩增(拷贝数≥6)
  • CTC计数与靶点共定位:CTC数量(≥1个/7.5mL血液)、靶点表达阳性率(≥20%)
外泌体靶点分析:
  • 外泌体表面蛋白靶点:PD-L1(表达量,流式细胞术MFI值)、CD63(阳性率≥80%)
  • 外泌体内核酸靶点:circRNA表达量(qPCRCt值≤38)、突变型DNA片段(数字PCRMAF≥0.01%)
融合基因转录本定位:
  • RNA原位杂交(RNA-ISH):融合基因转录本空间定位(细胞内颗粒状信号)、表达水平评分(信号密度:1-4级)
  • 单细胞RNA-seq:单个细胞内融合基因转录本(UMI计数≥5)、融合断点序列(覆盖≥10个reads)

检测范围

1.肿瘤组织标本:涵盖肺癌、乳腺癌、结肠癌等常见恶性肿瘤手术/活检组织,重点检测驱动基因突变(如EGFR、ALK)及蛋白靶点(如PD-L1)的空间定位与表达水平

2.细胞系标本:肿瘤细胞系(如A549、MCF-7)及正常对照细胞系,侧重靶点基因拷贝数变异(CNV)及融合基因(如EML4-ALK)的鉴定

3.血液标本:外周血、骨髓血等,重点检测循环游离DNA(cfDNA)中的突变位点(如KRASG12C)及循环肿瘤细胞(CTC)表面标志物(如EpCAM)

4.体液标本:胸腔积液、腹水、脑脊液等,侧重外泌体靶点(如miR-21)及脱落细胞内蛋白靶点(如CA125)的定位与定量

5.穿刺标本:肝穿刺、肾穿刺等小组织标本,重点检测癌基因(如MYC)扩增及抑癌基因(如p53)突变的空间分布

6.石蜡包埋标本(FFPE):archival组织标本,侧重靶点基因甲基化状态(如MGMT启动子甲基化)及蛋白表达(如HER2)的回顾性分析

7.新鲜冰冻标本:手术新鲜组织冰冻切片,重点检测融合基因(如ROS1)的原位杂交信号及蛋白靶点(如VEGF)的免疫荧光定位

8.尿液标本:尿液沉渣及尿液外泌体,侧重膀胱癌相关靶点(如FGFR3突变)及microRNA(如miR-155)的检测

9.唾液标本:唾液外泌体及脱落细胞,重点检测口腔癌相关靶点(如HPVE6/E7mRNA)及基因拷贝数变异(如CCND1扩增)

10.脑脊液标本:神经肿瘤患者脑脊液,侧重循环肿瘤细胞(CTC)靶点(如GFAP)及融合基因(如NTRK1)的检测

检测方法

国际标准:

  • ISO15189:2022医学实验室质量和能力要求(涵盖分子病理学检测的质量管理,包括方法验证、结果报告等环节)
  • ASTME2363-19荧光原位杂交(FISH)检测基因拷贝数变异的标准指南(规定了FISH检测的样本处理、探针设计及信号判读标准)
  • CLSIC24-A4临床分子生物学检测的质量保证(提供了PCR、测序等分子检测方法的验证流程及室内质控要求)
国家标准:
  • GB/T35029-2018分子病理诊断技术规范(明确了基因检测、免疫组化等方法的操作步骤及结果判读标准)
  • GB/T21767-2008临床实验室定量测定室内质量控制指南(适用于核酸定量检测的室内质控规则,如1-3s规则)
  • WS/T766-2020新型冠状病毒肺炎实验室检测技术指南(参考了分子检测的样本处理、核酸提取及PCR扩增流程)
方法差异说明:ASTME2363-19与GB/T35029-2018在FISH检测的信号判读标准上存在差异,ASTM要求每个样本至少计数200个细胞,而GB/T35029要求至少计数100个细胞;CLSIC24-A4与GB/T21767在PCR检测的室内质控规则上,CLSI推荐使用Westgard多规则(1-2s、2-2s等),而GB/T21767允许使用简化的1-3s规则。

检测设备

1.荧光原位杂交仪:雅培VysisPathVysion(检测通道:4色荧光,分辨率:≤100kb)

2.免疫组化染色仪:罗氏BenchMarkJianCeTRA(染色速度:60分钟/批,抗体加载精度:±1μL)

3.实时荧光定量PCR仪:AppliedBiosystemsQuantStudio7Flex(检测通道:6色,灵敏度:1copy/μL)

4.下一代测序仪:IlluminaNovaSeq6000(读长:150bppaired-end,通量:1.2Tb/run)

5.数字PCR仪:Bio-RadQX200(检测通道:2色,分辨率:0.01%突变丰度)

6.激光扫描共聚焦显微镜:蔡司LSM900(物镜:63×油镜,分辨率:≤200nm)

7.流式细胞仪:BDFACSAriaIII(检测参数:18色荧光,分选纯度:≥98%)

8.亚硫酸氢盐测序仪:ThermoFisherIonS5XL(读长:400bp,覆盖度:≥100×)

9.多重连接依赖探针扩增仪:MRC-HollandSALSAMLPA(检测位点:≤45个/反应,灵敏度:±1copy)

10.外泌体分离系统:ThermoFisherTotalExosomeIsolation(回收率:≥80%,纯度:CD63阳性率≥90%)

11.循环肿瘤细胞捕获仪:CellSearchSystem(捕获效率:≥80%,检测限:1个CTC/7.5mL血液)

12.甲基化特异性PCR仪:Bio-RadCFX96(检测通道:4色,重复性:CV≤5%)

13.RNA-seq文库制备系统:IlluminaNexteraXT(文库片段大小:300-500bp,产量:≥10ng/μL)

14.免疫荧光染色仪:LeicaBondMax(染色周期:30-90分钟,抗体交叉污染率:≤0.1%)

15.微阵列芯片扫描仪:AgilentSureScan(分辨率:2μm,动态范围:0-65535)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

中析仪器 资质

中析分子病理学靶点定位测定 - 由于篇幅有限,仅展示部分项目,如需咨询详细检测项目,请咨询在线工程师

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