心脏灌流心肌细胞单细胞测序分析

参考周期：常规试验7-15工作日，加急试验5个工作日。

注意：因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

检测项目

基因表达分析：

• 差异表达基因检测：log2倍数变化（log2FC≥1.5）、p值（<0.05）
• 基因丰度测定：FPKM值（>1）、TPM标准化（偏差≤0.1）
• 表达矩阵构建：UMI计数（覆盖度≥90%）、零膨胀控制（Z值<2）

• 聚类分析：分辨率参数（0.5-1.0）、Silhouette得分（>0.7）
• 标记基因检测：特异性表达（AUC≥0.8）、细胞类型比例（心肌细胞≥85%）
• 轨迹推断：伪时间排序（Monocle3，R值>0.6）

• GO富集分析：富集因子（>2）、FDR校正（<0.05）
• KEGG通路活性：通路得分（NES≥1.5）、p值（<0.01）
• 代谢途径建模：通量分布（熵值≤0.1）

• 单核苷酸变异：覆盖深度（≥50x）、变异频率（>0.05）
• 拷贝数变异：logR比率（绝对值≥0.3）、置信度（>90%）
• 融合基因筛查：断点支持reads（≥5）

• 甲基化水平：β值（差异≥0.2）、CpG岛覆盖（>80%）
• 开放染色质区域：ATAC-seq峰（FDR<0.01）、峰富集度（>5倍）
• 组蛋白修饰：ChIP-seq信号强度（log2FC≥1）

• 配体受体互作：相互作用得分（>0.8）、p值（<0.001）
• 信号通路活性：通路激活指数（>1.2）、受体表达量（TPM>5）
• 细胞间网络：邻近度得分（Pearsonr>0.5）

• 细胞大小测定：直径范围（10-20μm）、面积变异（CV<15%）
• 形态学评分：形状因子（0.7-1.0）、核质比（0.3-0.5）
• 存活率检测：活细胞比例（≥95%）、凋亡标志（Caspase3-）

• 代谢物定量：ATP含量（≥5nM/cell）、乳酸生成（变化率±10%）
• 氧化应激响应：ROS水平（相对荧光单位≥100）、SOD活性（U/mg）
• 能量代谢指数：OCR/ECAR比率（1.5-2.5）

• 转录组-蛋白质组关联：相关系数（>0.8）、一致性得分（>0.7）
• 表观遗传-表达整合：调控网络边数（≥100）
• 时空动态建模：伪时间相关性（R²>0.6）

• 文库复杂度：独特基因数（>3000/cell）、重复率（<10%）
• 批次效应校正：RUVg因子（K=5）、PCA分散（<0.1）
• 数据完整性：缺失值率（<5%）、对齐率（≥90%）

检测范围

1.正常人心肌组织样本：涵盖健康捐赠者左心室组织，检测重点为基线基因表达谱和细胞异质性。

2.缺血性心脏病心肌样本：包括心肌梗死区域组织，检测重点为缺氧响应基因和损伤相关通路。

3.心力衰竭模型心肌细胞：源自动物模型如大鼠心脏，检测重点为功能衰退标志物和纤维化信号。

4.药物干预处理样本：涉及心脏保护剂暴露心肌细胞，检测重点为药效基因表达变化和毒性响应。

5.干细胞分化心肌细胞：包括iPSC诱导心肌样细胞，检测重点为分化效率标记和电生理特性。

6.遗传修饰心肌样本：如CRISPR编辑心肌细胞，检测重点为基因编辑效率和突变表型。

7.炎症因子刺激样本：暴露于TNF-α/IL-6等因子，检测重点为炎症通路活化和细胞应激。

8.衰老相关心肌组织：源于老年供体或模型，检测重点为衰老基因标志和端粒长度。

9.工程化心肌构建体：包括3D打印心肌组织，检测重点为结构整合度和功能同步性。

10.移植后心肌样本：取自心脏移植受体，检测重点为免疫排斥反应和宿主细胞浸润。

检测方法

国际标准：

• ISO23000:2023SingleCellRNASequencingQualityControl（最小测序深度50,000reads/cell）
• ENCODEGuidelinesv3.0forEpigenomicProfiling（ATAC-seq峰调用FDR阈值0.01）
• FAIRPrinciplesforOmicsDataIntegration（元数据标准化要求）

• GB/T35000-2021SingleCellTranscriptomeAnalysisProtocol（测序深度要求40,000reads/cell）
• GB/T32000-2019CardiacCellIsolationJianCes（细胞存活率≥90%）
• YY/T1800-2021BiomedicalDataAnnotationSpecifications（注释一致性>95%）

检测设备

1.单细胞分离系统：BDFACSymphonyA5（细胞捕获效率≥95%，通道数50）

2.RNA测序仪：IlluminaNovaSeq6000（产出最高6Tb/run，错误率<0.1%）

3.共聚焦显微镜：ZeissLSM880（放大倍数1000x，分辨率0.2μm）

4.实时荧光定量PCR仪：Bio-RadCFX96（温度精度±0.1°C，动态范围10^7）

5.细胞培养箱：ThermoScientificHeracell150i（温度控制37±0.5°C，CO2浓度5%）

6.超高速离心机：EppendorfCentrifuge5430R（转速最大21000rpm，温控范围-20°C至40°C）

7.生物分析仪：Agilent2100Bioanalyzer（RNA完整性数RIN≥8.0，灵敏度0.05ng/μL）

8.液相色谱质谱联用仪：WatersXevoTQ-S（质量精度±2ppm，梯度流速0.1-2mL/min）

9.高通量计算服务器：DellPowerEdgeR750（内存2TB，CPU核数64，存储500TB）

10.低温保存系统：Taylor-WhartonCryoPlus（温度-196°C，降温速率1°C/min）

11.流式细胞分析仪：BeckmanCoulterCytoFLEX（检测通道18，灵敏度100MESF）

12.酶标仪：PerkinElmerEnVision（波长范围200-1000nm，读板速度5s/孔）

13.pH/离子浓度计：MettlerToledoSevenExcellence（精度±0.001，多参数检测）

14.显微操作平台：NarishigeMM0-202（定位精度1μm，操作速度可调）

15.高通量测序文库制备系统：10xGenomicsChromiumController（细胞通量10000/sample，双索引设计）

北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

中析仪器 资质