酵母菌基因表达检测

参考周期：常规试验7-15工作日，加急试验5个工作日。

注意：因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

检测项目

转录水平检测：

• qRT-PCR：Ct值、扩增效率（参照MIQE指南）
• RNA测序：基因表达丰度（FPKM/RPKM）、差异性表达分析（FDR<0.05）
• Northern Blot：杂交信号强度（灰度比值≥1.5）

• Western Blot：目标蛋白灰度值（相对内参校正）、条带迁移率
• ELISA：蛋白浓度（μg/mL，检测限0.1ng/mL）
• 质谱分析：肽段覆盖度（≥80%）、fold change（±2倍）

• 基因敲除表型：生长速率（OD600差值）、存活率（%）
• 过表达验证：表达载体拷贝数、功能增益效率（≥50%）
• 报告基因检测：荧光强度（RFU值，参照GFP标准）

• ChIP-qPCR：富集倍数（fold enrichment≥3）、峰位定位精度
• DNase I敏感性：切割位点密度（位点/kb）
• 甲基化测序：CpG岛甲基化率（%）

• HPLC：代谢物浓度（mmol/L）、保留时间偏差（±0.1min）
• 气相色谱：挥发性组分峰面积（相对标准偏差≤5%）
• 酶活测定：比活力（U/mg）、Km值计算

• MTT试验：细胞活力（吸光度OD570）、半数抑制浓度（IC50）
• 流式细胞术：凋亡率（%）、细胞周期分布（G1/S/G2比例）
• 荧光显微镜：GFP融合定位精度（亚像素级）

• 半衰期测定：RNA降解速率（t1/2，分钟）
• 核糖体分析：翻译效率（RPF密度）
• RNA编辑检测：编辑位点频率（%）

• 荧光素酶报告：光信号强度（RLU值，参照标准曲线）
• 转录因子结合：EMSA迁移率（偏移率%）
• 突变体筛查：活性变异系数（CV≤10%）

• 氧化胁迫：ROS水平（荧光强度）、抗氧化酶活性（SOD U/mg）
• 热激响应：HSP表达量（fold change）、热耐受时间（分钟）
• 营养限制：生长曲线斜率、代谢物积累量（mg/g）

• 微阵列芯片：探针杂交信号（Z-score）、聚类分析一致性
• CRISPR库筛选：sgRNA丰度（reads count）、表型得分
• 自动表型分析：菌落大小（mm²）、形态变异度

检测范围

1. 实验室标准酵母菌株： 包括S288C等模型株，重点检测基础转录组稳定性和管家基因表达基线

2. 工业发酵酵母： 涵盖面包酵母和酿酒酵母工程株，侧重代谢通路基因表达优化及产物产率关联分析

3. 基因编辑突变体： CRISPR/Cas9改造株，检测敲除/插入位点的表达沉默效率及脱靶效应

4. 胁迫适应样品： 高温、高渗或氧化条件培养物，关注应激基因（如HSP104）的上调幅度和恢复动力学

5. 不同生长阶段细胞： 对数期至稳定期样品，分析细胞周期相关基因（如CLN2）的表达时序变化

6. 共生培养体系： 与其他微生物共培养酵母，检测互作基因（如营养竞争相关因子）的表达互调

7. 重组蛋白表达株： 外源基因整合株，重点评估目标蛋白（如酶类）的表达水平及折叠正确性

8. 致病酵母模型： 假丝酵母类似株，检测毒力基因（如SAP家族）的表达模式及宿主响应机制

9. 环境分离株： 土壤或水体来源野生酵母，分析适应性基因（如抗逆因子）的进化表达差异

10. 高通量筛选库： 涵盖基因过表达或缺失库，检测批量样品中的表型-表达关联性及假阳性率

检测方法

国际标准：

• ISO 20184:2018 分子生物学检测方法—核酸定量分析
• ISO 21571:2013 食品微生物学—基因表达检测通则
• EN ISO 15216-1:2017 病毒检测中的分子方法参考

• GB/T 38504-2020 酵母菌基因表达检测技术规范
• GB/T 35855-2018 生物样品RNA提取与纯化方法
• GB/T 40978-2021 蛋白质免疫印迹检测通则

检测设备

1. 实时荧光定量PCR仪： QuantStudio 5型（检测通道数：6，动态范围：10^7）

2. 高通量测序仪： NovaSeq 6000型（读长：2×150bp，通量：20B reads/run）

3. 蛋白质印迹系统： Mini-PROTEAN Tetra电泳仪（电压范围：50-200V，凝胶尺寸：8cm×10cm）

4. 荧光显微镜： EVOS M7000型（分辨率：0.2μm，荧光通道数：4）

5. 高效液相色谱仪： Agilent 1260 Infinity II型（流速精度：±0.1%，检测波长范围：190-900nm）

6. 质谱分析仪： Q Exactive HF-X型（质量精度：<1ppm，扫描速度：18Hz）

7. 细胞培养箱： HERAcell 150i型（温度控制：±0.1°C，CO2调节：0-20%）

8. 超速离心机： Optima XE-100型（最大转速：100000rpm，控温精度：±1°C）

9. 分光光度计： NanoDrop One型（样品体积：1μL，吸光度范围：0.02-300A）

10. 流式细胞仪： BD FACSMelody型（检测参数数：14，流速：60μL/min）

11. 自动液体处理站： Bravo Automated Platform型（移液精度：±1%，通量：96孔板/批）

12. 恒温振荡器： Innova 42型（转速范围：20-500rpm，温度范围：4-80°C）

13. 凝胶成像系统： ChemiDoc MP型（检测灵敏度：0.1pg，像素分辨率：4.2MP）

14. 微孔板阅读器： SpectraMax iD5型（波长范围：200-1000nm，检测模式数：6）

15. 冷冻干燥机： FreeZone 4.5型（冷阱温度：-84°C，真空度：<0.001mbar）

北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

中析仪器 资质