转录组表达分析
转录组表达分析摘要：转录组表达分析是通过高通量测序技术检测生物样本中RNA表达水平的核心检测服务。核心检测对象包括mRNA、lncRNA等转录本，重点关注RNA提取质量、测序深度控制、基因表达量计算、差异表达筛选及功能注释。关键项目涵盖RNA完整性评估（RIN值≥7.0）、基因表达丰度分析（FPKM/RPKM标准化）、差异倍数统计（|log2FC|≥1）及通路富集分析（P值≤0.05），确保检测结果在基因组学研究中具有高精度和可重复性。
参考周期：常规试验7-15工作日，加急试验5个工作日。
注意：因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。
检测项目
RNA提取与纯化：
- RNA完整性检测：RIN值（≥7.0，参照Agilent 2100 Bioanalyzer）
- RNA浓度测定：纯度比值（A260/A280≥1.8，A260/A230≥2.0）
- 污染物清除：残留DNA水平（Ct值≥35，Qubit检测）
- 降解程度分析：28S/18S rRNA比值（≥1.5）
- 片段分布检测：DV200值（≥50%）
- 文库浓度控制：起始量（≥100ng RNA）
- 接头连接效率：分子标签匹配率（≥95%）
- 片段大小筛选：插入片段长度（200-500bp）
- 测序深度控制：覆盖度（≥30M reads/sample）
- 碱基质量评估：Q30分值（≥80%）
- 重复序列过滤：唯一比对率（≥70%）
- 表达丰度计算：FPKM/RPKM值（变异系数≤10%）
- 标准化处理：TMM/DEseq2校正
- 差异基因筛选：|log2FC|≥1，P值≤0.05（DESeq2算法）
- 聚类分析：热图距离矩阵（欧氏距离）
- GO富集：生物学过程P值（≤0.05）
- KEGG通路映射：通路覆盖率（≥5%）
- 剪接事件识别：PSI值（0-1范围）
- 异构体定量：Isoform比例（变异≤15%）
- miRNA表达：TPM值（检测限0.1TPM）
- lncRNA靶向预测：结合位点评分（≥0.7）
- qPCR验证：相关系数（R²≥0.9）
- 重复性测试：ICC值（≥0.8）
检测范围
1. 人类血液样本： 外周血单核细胞RNA，重点检测免疫相关基因表达和炎症通路富集。
2. 植物叶片组织： 水稻、玉米叶片RNA，侧重光合作用基因差异和环境胁迫响应分析。
3. 动物组织样本： 小鼠肝脏RNA，核心检测代谢通路基因表达和毒性响应机制。
4. 细胞培养样本： HEK293细胞系RNA，重点关注增殖基因表达和转染效率验证。
5. 肿瘤活检样本： 癌组织RNA，聚焦驱动基因突变表达和化疗耐药性标志物筛选。
6. 微生物群落样本： 土壤微生物总RNA，强调群落多样性分析和功能基因表达丰度。
7. 胚胎发育样本： 斑马鱼胚胎RNA，检测发育阶段特异性基因时序表达模式。
8. 神经组织样本： 大鼠脑RNA，侧重神经元标记物表达和突触可塑性通路。
9. 植物种子样本： 大豆种子RNA，重点分析贮藏蛋白基因表达和萌发调控机制。
10. 环境污染物样本： 水体浮游生物RNA，聚焦应激响应基因表达和生态毒性评估。
检测方法
国际标准：
- ISO 20184-3:2018 基于微阵列的转录谱分析
- EN 15633:2019 食品过敏原检测的转录组方法
- ISO/IEC 17025:2017 检测实验室通用要求
- GB/T 30988-2014 生物芯片技术规范和转录组分析
- GB/T 37871-2019 高通量测序数据质量控制
- GB/T 34796-2017 RNA提取纯化方法通则
检测设备
1. 高通量测序仪： Illumina NovaSeq 6000（测序深度100x，通量20B reads/run）
2. 分光光度计： Thermo Fisher NanoDrop One（检测范围0.2-1500ng/μL，精度±1%）
3. 生物分析仪： Agilent 2100 Bioanalyzer（RNA完整性RIN值0-10，分辨率0.1）
4. PCR扩增仪： Bio-Rad CFX96（温控精度±0.1℃，循环数40）
5. 离心机： Eppendorf 5425R（转速15000rpm，温度范围-10°C至40°C）
6. 微量分液系统： Hamilton Microlab STAR（分液精度0.1μL，误差±0.5%）
7. 恒温混匀仪： ThermoMixer C（震荡频率300-1400rpm，温控±0.5°C）
8. 核酸提取仪： Qiagen QIAcube（通量12样本/run，回收率≥90%）
9. 凝胶成像系统： Bio-Rad ChemiDoc（分辨率4MP，动态范围4-log）
10. 实时定量PCR仪： Roche LightCycler 480（检测通道6，灵敏度0.01ng）
11. 超低温冰箱： Thermo Scientific Forma 900（温度-86°C，稳定性±1°C）
12. 生物信息服务器： Dell PowerEdge R750（内存1TB，处理器32核）
13. 微量离心管： Eppendorf LoBind（容量0.5-2mL，吸附率≤1%）
14. 电泳系统： Bio-Rad Mini-PROTEAN（电压范围50-500V，凝胶尺寸8cm）
15. 振荡培养箱： New Brunswick Innova 44（转速50-400rpm，温度±0.2°C）
北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】
报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期：7~15工作日，可加急。
资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试：支持定制化试验方案。
售后：报告终身可查，工程师1v1服务。
中析仪器 资质
中析转录组表达分析 - 由于篇幅有限，仅展示部分项目，如需咨询详细检测项目，请咨询在线工程师
30485
