微生物群落结构PCR分析

参考周期：常规试验7-15工作日，加急试验5个工作日。

注意：因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

检测项目

DNA提取与纯化：

• 核酸浓度测定：OD260/280值（范围1.8-2.0）、DNA完整性（凝胶电泳条带清晰度）
• 杂质去除：蛋白质残留量≤0.05μg/μL、抑制剂检测（PCR抑制率≤5%）

• 引物设计：特异性引物Tm值（55-65℃）、扩增片段长度（100-500bp）
• 循环参数：退火温度梯度（±2℃优化）、扩增效率（Ct值≤35）

• OTU聚类：相似度阈值97%、序列比对长度（≥200bp）
• 多样性计算：Shannon指数（H'≥3.5）、Simpson指数（D≤0.1）

• 阳性对照：标准菌株扩增率≥95%、阴性对照无扩增信号
• 重复性测试：样本间变异系数CV≤10%

• 数据库匹配：RDP或SILVA数据库相似度≥97%、分类精度偏差±2%
• 功能预测：PICRUSt分析KEGG通路覆盖率≥90%

• 主坐标分析（PCoA）：距离矩阵计算（Bray-Curtis距离）、可视化聚类度≥85%
• 热图展示：物种丰度分层聚类阈值80%

• α多样性：Chao1指数≥150、观测物种数标准差±10
• β多样性：PERMANOVA检验P值≤0.05

• 均质化效率：细胞裂解率≥98%、颗粒残留量≤0.1mg
• 储存条件：DNA稳定性（-80℃保存期≥1年）

• 序列拼接：重叠群长度（≥300bp）、错误率≤0.1%
• 报告生成：多样性指数表格输出、群落结构图分辨率≥300dpi

• pH耐受：优化范围6.0-8.0、温度梯度（4-40℃稳定性）
• 抑制剂影响：重金属耐受浓度（如Cd≤10ppm）

检测范围

1.土壤样本：涵盖农田、森林及污染土壤，重点检测细菌群落多样性、重金属耐受菌丰度

2.水体样本：包括淡水、海水及废水，侧重藻类群落结构、病原体指示菌检测

3.人体肠道微生物：粪便或活检样本，核心分析益生菌比例、肠道菌群平衡度

4.空气样本：室内外空气滤膜，重点检测空气细菌浓度、真菌孢子分布

5.食品发酵样本：如酸奶、泡菜，侧重乳酸菌丰度、腐败微生物定量

6.植物根系样本：根际土壤或根组织，核心检测根瘤菌共生效率、病原真菌抑制率

7.工业废水样本：处理厂出水或污泥，重点分析污染物降解菌群落、生物膜结构

8.医疗环境样本：医院表面或器械，侧重病原微生物检出率、抗生素耐药基因

9.动物粪便样本：家畜或野生动物，核心检测肠道菌群组成、寄生虫共生关系

10.海洋沉积物样本：深海或海岸沉积物，重点分析极端环境微生物、有机物降解途径

检测方法

国际标准：

• ISO17601:2018土壤DNA提取与PCR分析
• ASTMD8083-21水体微生物群落高通量测序方法

• GB/T35890-2018微生物群落PCR检测技术规范
• GB/T40208-2021环境样本DNA提取与测序标准

检测设备

1.PCR扩增仪：ThermoFisherVeritiPro（温度梯度范围30-99℃，精度±0.1℃）

2.高速冷冻离心机：Eppendorf5430R（最大转速30000rpm，温度控制-20℃至40℃）

3.高通量测序仪：IlluminaNovaSeq6000（读取长度2x150bp，通量最高20Gb/run）

4.核酸定量仪：DeNovixDS-11FX（检测波长260/280nm，精度±0.01OD）

5.电泳系统：Bio-RadPowerPacBasic（电压范围10-300V，凝胶浓度1-2%）

6.恒温混匀仪：MajorScienceMV-1000（转速100-2000rpm，温度稳定性±0.5℃）

7.超低温冰箱：HaierDW-86L728（温度范围-86℃，容量728L）

8.生物安全柜：EscoAirstreamAC2-4S（气流速度0.45m/s，HEPA过滤效率99.99%）

9.均质破碎仪：BertinPrecellys24（转速500-10000rpm，破碎效率≥95%）

10.紫外分光光度计：ShimadzuUV-2600（波长范围190-900nm，分辨率0.1nm）

11.序列分析工作站：DellPrecision7865（处理器IntelXeon，内存256GB）

12.恒温培养箱：MemmertIPP500（温度范围0-70℃，湿度控制30-95%）

13.真空浓缩仪：LabconcoCentriVap（真空度≤1mbar，样本容量96孔）

14.液氮罐：Taylor-WhartonCX300（容量300L，维持时间≥30天）

15.显微镜系统：OlympusBX53（放大倍数40-1000x，成像分辨率0.2μm）

北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

中析仪器 资质