
炭疽杆菌地理溯源分析摘要:炭疽杆菌地理溯源分析是基于微生物基因组学与生物信息学的专业检测领域,其核心在于通过解析菌株的遗传特征,追溯疫情暴发的源头与传播路径。该分析通过比较不同分离株的单核苷酸多态性、基因组重排等分子标记,构建系统发育关系,为公共卫生事件的精准防控与调查提供关键的分子流行病学证据。
参考周期:常规试验7-15工作日,加急试验5个工作日。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。
1. 全基因组测序与分析:获取菌株完整基因组序列,为溯源提供基础数据。
2. 核心基因组多位点序列分型:分析多个保守管家基因序列,确定菌株的基本谱系。
3. 单核苷酸多态性分析:识别基因组中的特异性SNP位点,用于高分辨率分型与亲缘关系判断。
4. 毒力基因与质粒携带分析:检测编码毒素和荚膜的关键基因及其所在质粒的存在情况。
5. 抗菌药物耐药基因筛查:分析基因组中与耐药性相关的基因元件。
6. 基因组重排与结构变异分析:识别大片段插入、缺失、倒位等结构性变异。
7. 可变数目串联重复序列分型:对特定VNTR位点进行分型,用于快速初步鉴别。
8. 系统发育树构建:基于遗传距离,构建菌株间的进化关系树状图。
9. 群体遗传学分析:计算遗传多样性、种群结构等参数,推断传播动态。
10. 地理信息关联分析:将遗传分型数据与菌株分离地点、时间等信息进行整合关联。
11. 溯源报告生成与解读:综合各项分析结果,形成最终的溯源分析报告。
临床患者血液标本、皮肤病灶分泌物、尸体组织样本、环境土壤样本、水体样本、动物皮毛样本、可疑粉末样本、食品污染样本、实验室保存菌株、疫苗生产用菌种、疫区采集的昆虫样本、饲料样本、屠宰场环境拭子、生物恐怖袭击相关证物、畜牧场土壤、肉类加工厂环境样本、骨粉原料、进出口检疫截获物
1. 高通量基因测序仪:用于快速完成细菌基因组的大规模并行测序;具备长读长或短读长测序能力。
2. 核酸自动提取仪:高效纯化样本中的基因组脱氧核糖核酸;确保核酸的完整性与高纯度,满足后续测序要求。
3. 聚合酶链式反应仪:用于靶向基因片段的特异性扩增;为VNTR分型或特定基因检测提供模板。
4. 生物信息学分析服务器:运行基因组组装、比对、变异识别等计算密集型分析任务;配备高性能处理器与大容量内存。
5. 毛细管电泳仪:对PCR扩增产物进行片段大小分析;主要用于VNTR分型的精确读数。
6. 生物安全柜:为病原微生物样本的前处理提供无菌、安全的操作空间;防止操作人员感染和环境交叉污染。
7. 恒温培养箱:用于炭疽杆菌菌株的复苏与纯培养;提供稳定适宜的生长温度。
8. 超低温冷冻储存箱:长期保存原始样本、核酸提取物及标准菌株;确保生物材料的稳定性。
9. 凝胶成像系统:对电泳凝胶进行拍照记录与分析;用于初步验证PCR产物或核酸质量。
10. 生物信息学分析软件套件:集成基因组序列比对、注释、系统发育分析等多种专业算法;提供可视化分析界面。
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。










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